Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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