Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrlP06879 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrlP06879 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrlP06879 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrlP06879 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrlP06879 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrlP06879 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrlP06879 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrlP06879 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrlP06879 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrlP06879 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrlP06879 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrlP06879 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrlP06879 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms