Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa4P06798 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms