Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06336 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06336 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06336 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06336 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06336 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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