Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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