Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01735 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01735 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01735 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
P01735 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01735 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01735 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01735 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01735 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01735 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms