Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01680 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01680 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01680 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01680 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01680 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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