Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms