Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms