Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Best1O88870 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Best1O88870 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Best1O88870 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Best1O88870 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Best1O88870 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Best1O88870 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Best1O88870 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Best1O88870 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms