Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hcn1O88704 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hcn1O88704 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hcn1O88704 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hcn1O88704 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn1O88704 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hcn1O88704 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hcn1O88704 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Hcn1O88704 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Hcn1O88704 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hcn1O88704 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hcn1O88704 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn1O88704 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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