Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dll3O88516 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms