Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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