Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme6O88425 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme6O88425 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme6O88425 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme6O88425 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms