Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vti1bO88384 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms