Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd46O88174 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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