Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SfnO70456 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms