Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg2O55111 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms