Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a2O54833 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms