Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rab33bO35963 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab33bO35963 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms