Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms