Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnnd2O35927 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnd2O35927 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnd2O35927 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnd2O35927 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnd2O35927 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnnd2O35927 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd2O35927 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms