Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms