Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn6O35646 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn6O35646 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn6O35646 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms