Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Prrt1O35449 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt1O35449 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt1O35449 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Prrt1O35449 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Prrt1O35449 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prrt1O35449 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Prrt1O35449 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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