Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-ObO35424 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-ObO35424 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-ObO35424 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2-ObO35424 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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