Protein–RNA interactions for Protein: O35181

Nrg3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrg3O35181 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrg3O35181 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms