Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms