Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ArxO35085 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ArxO35085 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ArxO35085 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ArxO35085 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ArxO35085 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ArxO35085 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ArxO35085 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ArxO35085 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ArxO35085 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ArxO35085 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms