Protein–RNA interactions for Protein: O08966

Slc22a1, Solute carrier family 22 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a1O08966 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc22a1O08966 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a1O08966 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms