Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ephb6O08644 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb6O08644 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms