Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CltaO08585 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CltaO08585 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CltaO08585 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CltaO08585 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CltaO08585 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CltaO08585 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CltaO08585 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CltaO08585 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CltaO08585 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CltaO08585 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CltaO08585 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CltaO08585 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CltaO08585 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CltaO08585 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CltaO08585 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CltaO08585 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CltaO08585 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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