Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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