Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm379J3QQ19 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms