Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm8888J3QPX5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8888J3QPX5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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