Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms