Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930544D05RikJ3QK56 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms