Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms