Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms