Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H5

Tpte, MCG118205, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpteG5E8H5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpteG5E8H5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms