Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r67G5E8C1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms