Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms