Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Obox6G3X9U1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Obox6G3X9U1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms