Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XntrpcF8VQM8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XntrpcF8VQM8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XntrpcF8VQM8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
XntrpcF8VQM8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XntrpcF8VQM8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms