Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms