Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5861F6VCN9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Gm5861F6VCN9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm5861F6VCN9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms