Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933403O08RikF6UK53 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms