Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa27F2Z403 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa27F2Z403 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa27F2Z403 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa27F2Z403 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa27F2Z403 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa27F2Z403 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa27F2Z403 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms