Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms