Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc71lE9Q4T4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccdc71lE9Q4T4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc71lE9Q4T4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc71lE9Q4T4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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